Der Virus überlebt auf Pflanzenteilen und natürlich auf anderen Pflanzen.
Du musst also nicht die gesamte Erde austauschen, aber sorgfältig Wurzelreste etc. raus holen.
Da ToMV über 200 Wirtspflanzen hat (auch einheimische Wildkräuter etc.) kann er natürlich auch da schon sitzen.
Aber, da Du sehr früh eingefriffen hast, sind deine Chancen noch gut.
Beim Pflanzen entsorgen: An Ort und Stelle große Mülltüte über die Pflanzen stülpen, ehe Du sie aus der Erde ziehst. (Einweghandschuhe tragen)
So kannst Du schon beim Entsorgen die Verteilung der Viren überall deutlich eindämmen.
Dann die Säcke seeeeehr gut zuschnüren und im Hausmüll entsorgen.
Hinterher Dich, die Kleidung etc. waschen bzw. desinifizieren.
Zur verbleibenden Erde:
Es gibt in der Fachliteratur Berichte, dass der Mosaikvirus teilweise (nicht zu 100 %) durch die Hitze und die Mikroorganismen bei Kompostierungsprozessen abgetötet wird.
Es wäre also sinnvoll, die Fläche jetzt möglichst schnell in einen - niedrigen - Komposthaufen zu verwandeln. Ordentlich Material aufhäufen und immer gut am Leben halten, damit sich dort ordentlich Hitze entwickelt.
Eventuell wäre es sogar hilfreich den Boden vorher per "Mistbeet" aufzuheizen. Aber dazu habe ich keine Untersuchungen gefunden. Ist nur so ein Gedanke, um die Hitzeentwicklung zu beschleunigen und es den Mikroorganismen leichter zu machen.
Wenn der Kompost gar ist, untergraben.
Nach meiner Erfahrung reagieren Tomatillos (Physalis ixocarpa / Physalis philadelphica) seeeeehr viel empfindlicher auf den ToMV als z. B. Tomaten.
Du kannst Sie also als "Zeigerpflanzen" verwenden.
Wenn der Kompost gar ist und untergegraben, einfach mal Tomatillos aussäen. Schon die sehr jungen Pflanzen zeigen die Infektion.
Auch jetzt könntest Du rundum im Garten mal Tomatillos aussäen, nur um zu gucken, ob da sonst noch Problemstellen sind. Musst die Pflanzen ja nicht gigantisch groß werden lassen, wenn Du keine Tomatillos magst. Geht ja nur darum Blattveränderungen zu sehen.
Mehr fällt mir leider nicht ein.
Ist mit viel Arbeit verbunden, wenn man sich den Virus erst mal eingefangen hat.
Aber je schneller man reagiert, umso besser sind die Chancen ihn zumindest wieder einzudämmen.